熱田神宮の奥深くに神体として安置されているという説。神話の記述の通りであればこうなる。
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これに拠れば668年に新羅の僧・道行が熱田神宮の神剣を盗み、新羅に持ち帰ろうとした。しかし船が難破して失敗し、その後は宮中で保管されていた。688年に天武天皇が病に倒れると、これが神剣の祟りだということで熱田神宮に戻された。
江戸時代の神官が神剣を盗み見たとの記録がある。それによれば長さは2尺8寸（およそ85センチ）ほどで、刃先は菖蒲の葉に似ており、全体的に白っぽく、錆はなかったとある。神剣を見た神官は祟りで亡くなったとの逸話も伝わっている。現代になってNHKが熱田神宮に取材に行っているが、問題の神剣は見せてもらえなかった。（『古代史の謎に挑むI』より）
また、熱田神宮に祀られている神剣と皇室（大和王権）とは元々関係ないが、これを皇室を結びつけるために神話の記述が作られたという説や、逆に大和王権が尾張氏を取り込むために剣を贈り、これが神剣となったとする説などがある。
壇ノ浦水没説
平家滅亡の折に、二位の尼が腰に差して入水し、そのまま上がっていないとする説。
『吾妻鏡』の壇ノ浦の戦いの元暦二年三月二十四日の条で「二位ノ尼は宝剣（天叢雲剣）を持って、按察の局は先帝（安徳天皇）を抱き奉って、共に海底に没する。」とある。また戦いの後の元暦二年四月十一日の条に戦いでの平氏方の戦死者、捕虜の報告に続いて「内侍所（八咫鏡）と神璽（八尺瓊勾玉）は御座すが。宝剣（天叢雲剣）は紛失。」と記されており、古くから唱えられた説のひとつである。
この時に所持していた物は宮中で元々使用されていた模造品という説がある。「平家物語-剣巻」なども、その説を採る。
宮中儀式に使われているものが本物だという説である。